Treffen der AFM-Arbeitsgruppe: Kommen Enteroviren 2021 zurück, nachdem COVID 19 nachlässt?

18. März 2021

PDF-TRANSKRIPT

Carlos Pardo: [00:00:00] Guten Tag zusammen. Dies ist das März-Treffen der Arbeitsgruppe Akute schlaffe Myelitis. Vielen Dank an alle in den Vereinigten Staaten und anderen Ländern, die an dem Treffen teilgenommen haben. Die Acute Flaccid Myelitis Working Group ist eine Gruppe von klinischen Wissenschaftlern, Forschern, Gesundheitsdienstleistern und Eltern, die sich auf das Verständnis der akuten schlaffen Myelitis und insbesondere auf die Verbesserung der akuten schlaffen Myelitis und insbesondere auf die Pflege und Verbesserung der akuten schlaffen Myelitis konzentrieren Myelitis und die Pflege und Verbesserung der Gesundheitsversorgung für Patienten, die von dieser Erkrankung betroffen sind. Heute haben wir ein virtuelles Forum, das sich auf einen kürzlich in Science Translational Medicine veröffentlichten Artikel über die Zirkulation von Enteroviren konzentrieren wird.

[00:01:05] Aber bevor wir ins Forum gehen, möchte ich einige Ankündigungen machen. Die erste Ankündigung ist, dass sich die Arbeitsgruppe für akute schlaffe Myelitis jeden Monat trifft. Die dritte, die dritte Woche des Monats. Das nächste Treffen findet am 22. April statt. Ich ermutige die Menschen, an dem virtuellen Treffen teilzunehmen, da es sich darauf konzentrieren wird, was mit akuter schlaffer Myelitis auf der ganzen Welt vor sich geht. Und wir werden eine Teilnahme von Forschern und Wissenschaftlern aus der ganzen Welt haben, die Erfahrung mit akuter schlaffer Myelitis haben. Und wir würden gerne von ihnen erfahren, was mit akuter schlaffer Myelitis in anderen Teilen der Welt als in den Vereinigten Staaten vor sich geht. Die zweite Ankündigung ist, dass eine Naturgeschichte-Studie zu akuter schlaffer Myelitis im Gange ist. Es wurde vom NIH ins Leben gerufen und hat seinen Sitz an der University of Alabama in Birmingham.

[00:02:00] Dies umfasst also mehr als 30 medizinische Zentren, die Patienten mit akuter schlaffer Myelitis oder Nachahmern für eine Studie dieser Störung rekrutieren. Daher ermutigen wir alle Menschen in den Vereinigten Staaten und Kliniker, die Patienten oder Verdachtspatienten haben, sich mit uns in Verbindung zu setzen, falls Interesse besteht, Patienten für die Studie zu überweisen. Wir sind sehr interessiert und wachsam und bereit, mit einem möglichen Ausbruch der akuten schlaffen Myelitis in den Jahren 2021 und 2022 fertig zu werden. Also noch einmal, die Natural History Study zur akuten schlaffen Myelitis, die an der UAB angesiedelt ist und von Dr. David Kimberlin geleitet wird diese Studie. Ich meine, alle Gruppen sind im Grunde sehr wachsam, um mit der Rekrutierung und Bewertung von Patienten mit dieser Störung zu beginnen. Mit dieser kurzen Einführung möchte ich das Mikrofon an meinen Kollegen Dr. Kevin Messacar von der University of Colorado weiterreichen, der dieses Symposium moderieren wird. Kevin.

Dr. Kevin Messacar: [00:03:14] Vielen Dank, Carlos, und vielen Dank, dass Sie diese Sitzung zusammengestellt haben, und hoffentlich wird sie interessant und informativ. Bevor wir anfangen, freue ich mich sehr, Robin Roberts vorstellen zu können, um eine sehr aufregende Ankündigung zu machen, denke ich, für unsere Arbeitsgruppe und für AFM im Allgemeinen. Robin und ich haben uns, glaube ich, 2014 kennengelernt. Das ist jetzt mehrere Jahre her. Und sie ist eine der erstaunlichsten Elternvertreterinnen für AFM. Und die Arbeit, die sie zusammen mit der AFM Association geleistet hat, war einfach unglaublich, und ich lasse sie Ihnen ein wenig von ihrer Geschichte erzählen und die aufregende Ankündigung machen, bevor wir zum Panel kommen. Du kannst weitermachen, Robin.

[00:03:59] Ja.

Robin Roberts: [00:04:00] Vielen Dank, Dr. Messacar, und danke an die Arbeitsgruppe, die mir erlaubt hat, heute Nachmittag für einige Momente etwas vorzustellen. Bei meinem Sohn Carter wurde im Jahr 2016 sehr plötzlich AFM diagnostiziert, im Alter von dreieinhalb Jahren und buchstäblich über Nacht war einer der Patienten, die schwer betroffen waren, innerhalb weniger Stunden entlüftungsabhängig. Und abgesehen davon, dass er letztendlich alle Diagnosen ausprobierte, die damals wahrscheinlich wirklich Ideen waren, konnte er nur die Kontrolle über ein paar Zehen zurückgewinnen. Und so verstarb er leider im August, oh Entschuldigung, im September 2018. Und durch die Arbeitsgruppe, durch die AFM-Community, immer auf der Suche nach Wegen, sich einzusetzen, Spenden zu sammeln und etwas zu bewirken. Aber ich arbeite auch beruflich im Gesundheitswesen. Also, eines der Dinge, die ich weiß … Entschuldigung, eines der Dinge, die ich weiß, ist, dass Versicherungsunternehmen Codierungen benötigen, um Patienten zu identifizieren, die Deckung abzustimmen und zu verstehen, was mit dem Patienten los ist. Und dies ist eine der wenigen Möglichkeiten, wie wir einer Versicherungsgesellschaft, sogar Forschern, die nach Patientendaten suchen, mitteilen können, wie sie jemanden finden können.

[00:05:12] Also, um aufzuhören, pa-, Patienten mit einer generischen Diagnose oder nicht mit einer spezifischen Diagnose zu bezeichnen, die zu dem passt, was wir jetzt klinisch als akute schlaffe Myelitis definieren und identifizieren können. Im vorletzten Jahr habe ich versucht, einen bestimmten Code zu bekommen, der auf jeden Fall gehen kann, egal ob Sie stationär in der Akutphase sind, Sie mit einem sekundären Problem zu tun haben, vielleicht mit einem Lungenarzt oder einem Therapeuten, oder sogar Jahre später, wenn Sie immer noch versuchen, Fortschritte zu machen. Und so, dieses Jahr oder erst letztes Jahr, im zweiten Jahr des Versuchs, mit der Unterstützung der CDC, Dr. Janell Routh, Dr. Kevin Messacar, der hier ist, dem ich wahrscheinlich viel zu viele getwittert und geschrieben habe In den letzten fünf Jahren habe ich mehrmals gesagt, dass ich das nicht alleine schaffen kann. Sie sagten, ich weiß nicht … ich bin nicht, ich bin nicht klinisch relevant genug. Und so kamen sie mir zu Hilfe, um gegen einige der Gesundheitsinformationsverwaltungen im CDC-Prozess zu kämpfen, um einen bestimmten Code zu erhalten.

[00:06:11] Und gemeinsam mit ihnen und der Unterstützung der Community freuen wir uns sehr, ankündigen zu können, dass ab dem 1. Oktober dieses Jahres ein Arzt einen Patienten, bei dem AFM klinisch diagnostiziert wurde, spezifisch kennzeichnen kann durch a Arzt, um einen Code auf einen Anspruch zu nageln. Und so kann der Code G04.82 verwendet werden, um die Ungleichheit bei der Kodierung zu stoppen, zu definieren, wer diese Patienten sind, sie zu identifizieren und sie zu quantifizieren. Und dies wird dazu beitragen, Forschung, Therapien und verwandte medizinische Versorgung für Geräte und Ausrüstung zu leiten und letztendlich dazu beitragen, diese gesamte Bevölkerung zu verfolgen und besser zu verwalten und zu unterstützen. Also vielen Dank an Dr. Kevin Messacar. Nochmals vielen Dank an die Arbeitsgruppe für Ihre Zeit. Ich bin nur sehr aufgeregt, dass wir das jetzt haben können.

Carlos Pardo: [00:07:01] Robin, macht es dir was aus, den Code für AFM ist G zu wiederholen?

Robin Roberts: [00:07:06] G0482. G04.82 wird also offiziell Teil dieser ganzen Enzyklopädie von Codes. Es kann mit anderen Symptomen und anderen Dingen, die bei Ihren Patienten vor sich gehen, als primäre Diagnose beim Patienten und dann bei allen nachfolgenden Besuchen als sekundäre Diagnose für jedes Problem im Zusammenhang mit AFM kombiniert werden, um uns zu helfen, diese Patienten zu verfolgen.

Dr. Kevin Messacar: [00:07:33] Vielen Dank, Robin. Dies alles war Ihren Bemühungen zu verdanken, aber auch eine wunderbare Geschichte darüber, wie die Arbeitsgruppe arbeitet, die Eltern, Ärzte, öffentliche Gesundheit und die CDC zusammenbringt, um dies zu unterstützen. Es ist einfach eine wunderbare Geschichte von praktischen Fortschritten auf diesem Gebiet. Und wie Sie sagten, ich denke, es wird helfen, klinisch diagnostizierte Fälle zu quantifizieren, die möglicherweise nicht die epidemiologischen Fallkriterien erfüllen. Es wird Familien mit Versicherungsproblemen helfen und uns insgesamt dabei helfen, diese Krankheit zu definieren und mehr darüber zu verstehen. Nochmals vielen Dank für all Ihre Bemühungen. Und, und ich kann es wirklich nicht oft genug sagen, ich bin einfach nur beeindruckt von dem, was du kannst, du warst in der Lage, das zu tun, und es ist so eine Ehre und ein Tribut an Carter. So danke.

Robin Roberts: [00:08:20] Danke.

Dr. Kevin Messacar: [00:08:23] Also, als nächstes möchte ich Dr.… vorstellen. angehender Dr. Daniel Park, Doktorand in Princeton unter der Leitung von Bryan Grenfell, der in mathematischer Modellierung und Epidemiologie arbeitet. Und noch ein Glückwunsch zum Weitergeben, ich habe gerade eine wunderbare Modellierungsstudie in Science Translational Medicine veröffentlicht, die die geografische und zeitliche Zirkulation des Enterovirus 68 in Fällen von AFM, die seit 2014 im ganzen Land beobachtet wurden, etwas detaillierter darstellt. Also, Wir beginnen mit einer kurzen Präsentation von Daniel, und dann öffnen wir sie und ich stelle unsere anderen Diskussionsteilnehmer vor. Und zögern Sie nicht, Fragen im Chat zu stellen, während wir weitermachen, und wir werden sie danach Daniel und dem Rest unseres Panels stellen. Also, Daniel, du kannst es wegnehmen.

Sang (Daniel) Woo Park: [00:09:18] Vielen Dank für die Einführung, Kevin, und vielen Dank, dass Sie dies eingerichtet haben und kommen. Ich freue mich sehr, unsere Arbeit zur epidemiologischen Dynamik teilen zu können. Also Enterovirus D68 in den Vereinigten Staaten und Auswirkungen auf die akute schlaffe Myelitis. Vor 2020 sahen wir alle zwei Jahre AFM-Fälle, und auch Enterovirus-D68-Fälle wurden alle zwei Jahre gemeldet, was auf eine gewisse Korrelation zwischen D68 und AFM hindeutet. Aber es gab noch einige offene Fragen, die es zu beantworten galt. In dieser Studie wollten wir also fragen, ob wir geografische Unterschiede im Zeitpunkt des Enterovirus-D68-Ausbruchs erklären können, weshalb es in einigen Staaten zu späteren oder früheren Ausbrüchen kommt, und ob wir die Saisonalität von D68-Ausbrüchen und AFM-Ausbrüchen in Beziehung setzen können über verschiedene Staaten. Und was, was, was treibt solche zweijährigen Muster an? Warum bekommen wir alle zwei Jahre und jedes Jahr Ausbrüche? Und wird sich dieses Muster, das zweijährige Muster, fortsetzen? Ist das, bleibt diese Art von Zustand bestehen? Und bedeutet das, dass wir 2020 einen Ausbruch bekommen können? Dann werden wir … wir haben im September 2019 begonnen, an diesen Fragen zu arbeiten, und als 2020 kam, gab es COVID und nicht-pharmazeutische Interventionen, soziale Distanzierung usw. und wir wollten verstehen, was diese in Bezug auf D68-Ausbrüche für 2020 und möglicherweise für die Zukunft bedeuteten .

[00:10:53] Diese Arbeit basiert also auf … diese Arbeit baut auf der Arbeit unserer Mitarbeiterin Margarita Pons-Salort und von Mitarbeitern der CDC auf, die sich mit der Saisonalität anderer Enterovirus-Ausbrüche in den USA befassten, die diese südlichen Bundesstaaten zeigten frühere Ausbrüche bekommen als die nördlichen Bundesstaaten, was eine gewisse Rolle des Klimas bei der Gestaltung der Übertragung von Enteroviren offenbarte. Und auch Margaritas Arbeit über Enterovirus D68 und endemische Enteroviren in Japan, wo sie zeigen konnte, dass diese komplexe Ausbruchsdynamik insbesondere hier zu sehen ist, dass Coxsackievirus A2 und A4 zweijährige Muster aufweisen, genau wie Enterovirus D68. Sie zeigte, dass diese Muster durch die SIR-Dynamik erklärt werden können, womit wir, wir, wir meinen, dass Menschen mit lebenslanger serotypspezifischer Immunität diese zweijährigen oder noch komplexeren Muster erklären können. Um diese Fragen zu beantworten, verwenden wir Daten von BioFire, das eine Multi-Pathogen-Multiplex-PCR erstellt, den Test für mehrere Chargen von Himbeermustern gleichzeitig, und insbesondere das Vorhandensein von D68 vorhersagen kann aus diesen Paneldaten von den, auf Rhinovirus, Enterovirus getesteten.

[00:12:31] Zuvor hat sich die Enterovirus-Überwachung in den USA auf passive Überwachung verlassen, aber mit dieser krankenhausbasierten Überwachung sind wir in der Lage, genauere Details darüber zu erhalten, wie D68 in verschiedenen Staaten in einem feineren Zeitrahmen zirkuliert. Hier möchte ich also zeigen, wie die Daten in Panel A aussehen, wir sehen Daten aus den USA und die Staaten, dass dort, wo viele Daten wie Sie von hier stammen, Sie feststellen werden, dass einige der Staaten verklumpt wurden Sie finden zum Beispiel Colorado und Florida, Georgia und South Carolina zusammen, das liegt daran, dass wir diese Daten aufgrund von Vertraulichkeitsanforderungen zusammenfassen müssen. Aber insgesamt sehen wir, wie wir in den USA, New York und an einigen anderen Orten sehen, klare Muster von Ausbrüchen, die alle zwei Jahre auftreten. Aber an einigen Orten wie Ohio sehen wir ein komplizierteres Muster, bei dem es so aussieht, als würde es alle vier Jahre zu einem Ausbruch kommen.

[00:13:28] Also, wir, wir, wir wollen zuerst verstehen, wann diese Ausbrüche passieren, was wir versuchen in Abbildung B anzuwenden, das ist im Wesentlichen, wenn Ausbrüche passieren, aber wir können zeigen, dass diese das Timing sind des Ausbruchs, die sich hier auf den Schwerpunkt beziehen, und die Abbildungen C und D sind mit dem mittleren Breitengrad und dem mittleren Längengrad korreliert. Dies steht im Einklang mit früheren Arbeiten zu anderen Enteroviren, die hervorheben, dass frühere Staaten im Wesentlichen südliche Staaten frühere Ausbrüche bekommen, nördliche Staaten spätere Ausbrüche bekommen, was auf die Rolle des Klimas bei der Gestaltung der Ausbreitung des Enterovirus D68 hinweist.

[00:14:07] Dann wollten wir diese Muster mit der AFM-Dynamik korrelieren. In Abbildung A zeigen wir die D68-Ausbrüche als Balkendiagramme und die AFM-Zahl, AFM-Fälle als rote Linien. Wie wir sehen, gibt es eine sehr klare Korrelation zwischen dem Aussehen der AFM-Ausbrüche und den D68-Ausbrüchen, obwohl es einige Unterschiede gibt, dass der AFM-Ausbruch anscheinend seit 2012, 2014 zugenommen hat, wo der D68-Ausbruch ziemlich stabil war. Es ist noch unklar, ob dies eine tatsächliche Zunahme von AFM-Fällen darstellt oder nur eine bessere Überwachung widerspiegelt. Wir sehen auch, dass AFM-Fälle anscheinend einen Monat später als die D68-Fälle ihren Höhepunkt erreichten, was wir in Abbildung B und C gezeigt haben. Sie können auch in Abbildung A sehen, aber dies ist wahrscheinlich auf die Aggregation der Daten zurückzuführen. Also AFM, wir schauen uns nur nationale Daten an, während wir uns BioFire nur ansehen, wir schauen uns ungefähr 20 Staaten an. Es deckt also nicht alle Staaten und ihre Unterschiede ab, es gibt unterschiedliche Überwachungsebenen, abhängig von der Verwendung von BioFire-Panels in verschiedenen Staaten.

[00:15:37] Aber nichtsdestotrotz, in Abbildung D und E, wie wir zeigen, gibt es a, also ist D ein Plot von Korrelationskoeffizienten zwischen AFM-Fällen und D68-Fällen, wobei Gelb eine höhere Korrelation ist, die für fast alle Staaten gilt, Es gibt eine, siehe positive Korrelationen. Und in Abbildung E sehen wir wieder, dass es eine verrauschte, aber positive Korrelation gibt, die schwarze Linie steht für die nationalen und die roten Linien für jeden Staat. Es scheint also, als gäbe es eine sehr klare positive Korrelation zwischen dieser Anzahl von D68-Fällen und AFM-Fällen, die auch andere Studien zuvor festgestellt haben, wir sind hier, wir schauen uns Upgrades an, um es genauer zu betrachten skalieren über eine Vielzahl von Staaten.

[00:16:29] Wenn wir uns hier in New, New York und Utah und Colorado noch feinere Daten ansehen, sehen wir wieder, dass das Timing von AFM-Fällen mit dem Timing übereinstimmt, das Timing von AFM-Ausbrüchen mit dem Timing von D68 übereinstimmt Ausbruch. Und wir sehen auch nicht die Verzögerung, die wir zuvor erwähnt haben, was wiederum unterstreicht, dass die Verzögerung wahrscheinlich durch geografische Unterschiede bei der BioFire-Einsatzüberwachung und eine Art Aggregationsproblem verursacht wird, das die echte biologische Verzögerung nicht widerspiegelt. Wir wollten also wissen, was die zweijährlichen Muster von D68-Ausbrüchen antreibt? Warum kommt es alle zwei Jahre zu einem D68-Ausbruch? Also haben wir die Methodik von Margarita übernommen. Sie waren sich sicher, dass sie es verwenden … es wurde sowieso verwendet, um andere Enteroviren zu untersuchen. Im Wesentlichen können wir also ein mathematisches Modell entwickeln, das von lebenslanger Immunität ausgeht. Sobald Menschen infiziert sind, erholen sie sich vollständig und dann können sie … sie können sich nicht erneut infizieren. Und die … in einem solchen Modell können wir zeigen, dass es mit der beobachteten Dynamik von D68 ziemlich gut übereinstimmen kann.

[00:17:52] Also, hier die Hardware der weißen, weißen Tafeln, wir haben versucht, das Modell an die Daten anzupassen. Und in Orange versuchen wir, zukünftige Dynamiken vorherzusagen. Also, in einigen Fällen, Missouri und Utah, Colorado, sehen die Anpassungen und Vorhersagen sehr gut aus. Sie schauen sich Ohio Fits an, aber Vorhersagen sind ein bisschen schwierig, nur in der Vorhersage, versprechen kurze Zeitreihen, die schwierig sein können. Aber wenn wir versuchen, mehr Daten einzubeziehen, sehen wir, dass wir eine bessere Vorhersage erhalten, die darauf hindeutet, dass die lebenslange Immunität gegen eine Enterovirus-D68-Infektion allein tatsächlich die Dynamik, die Ausbruchsdynamik, die alle zwei Jahre stattfindenden Muster der D68-Ausbrüche erklären kann. Wir möchten, wir möchten betonen, dass es hier darauf ankommt, dass unsere Forschung darauf hindeutet, dass eine Primärinfektion wahrscheinlich wichtig ist. Es schließt also nicht unbedingt die Möglichkeit von Sekundärinfektionen aus, aber solange Sekundärinfektionen nicht zu einer erheblichen Übertragung führen, stimmt es mit unserem Modell überein.

[00:19:12] Und wir haben diese Simulationen weiter getestet, damit wir auch zeigen konnten, dass die Ausbrüche nicht alle zwei Jahre andauern, dass zweijährliche Muster nicht unbedingt stabil sein müssen. Wann, also wann 2020 kam, mussten wir uns nun fragen, welche Auswirkungen diese Pandemie auf die D68-Dynamik hat? Was sind nicht-pharmazeutische Interventionen, soziale Distanzierungsmaßnahmen, die mit einer Verbreitung von D68 zu tun haben. Anfang 2020 verzeichneten wir in anderen Ländern einen Rückgang der Enterovirus-Fälle. Schnelle Rückgänge. Hier zeige ich Hongkong, Südkorea, Taiwan. Etwa im März, April meldeten sie im Wesentlichen fast keine Enterovirus-Fälle. In den USA haben wir leider keine Daten, insbesondere weil der D68-Vorhersagealgorithmus von BioFire auf bestimmten, bestimmten Versionen basiert, die aber nach deren Produktupdate nicht mehr verfügbar waren. Aber wir können es immer noch, da wir immer noch unser mathematisches Modell verwenden können, um vorherzusagen, ob ein Ausbruch im Jahr 2020 möglich gewesen wäre. Und was ist, wenn die Kontaktrate und damit die Übertragungsrate aufgrund von Distanzierungsmaßnahmen sinken? Und was würde das im Hinblick auf zukünftige Ausbrüche bedeuten?

[00:20:48] Hier haben wir also die Möglichkeit eines D68-Ausbruchs im Jahr 2020 in einer Vielzahl von Szenarien bewertet, zunächst unter normalen Bedingungen, und während die Übertragung um 5 %, 10 % und 20 % abnimmt. Hier sehen wir also im obersten Feld, Feld B, einen gelben Streifen um den September herum, der darauf hinweist, dass ein großer Ausbruch im Jahr 2020 möglich gewesen wäre. Aber wie wir sehen, wenn wir einführen, abnehmen, wenn wir die Übertragungsrate verringern, verschwinden diese Streifen, was darauf hindeutet, dass selbst eine bescheidene Verringerung der Übertragungsrate um 20 % den Ausbruch hätte verhindern können. Also, diese Arbeit, diese Vorhersagen, die wir ursprünglich im April, im April und März gemacht haben. Wie von uns prognostiziert, gab es im Jahr 2020 keine AFM-Ausbrüche, obwohl wir aufgrund der Produktaktualisierung leider nicht beurteilen können, ob es keine D68-Ausbrüche gab. Es gab also sicherlich einen Rückgang der Berichte über D68, und ich denke, andere Leute, Kevin, einschließlich Kevin, könnten ihre Erkenntnisse aus klinischen, klinischen Erkenntnissen teilen.

[00:22:07] Also, was bedeutet das in Bezug auf … was, was wird, was wird für zukünftige Ausbrüche passieren? Würden wir 68, 21 mehr D2021-AFM-Ausbrüche bekommen? Wir haben keine Daten für D2022. Aber wir möchten auf eine von Rachel Baker in unserer Gruppe geleitete Studie anspielen, die direkt versucht, diese Frage allgemein für endemische Krankheiten zu beantworten, dieses Papier, in dem sie sich auf RSV konzentriert, aber die allgemeinen Schlussfolgerungen werden immer noch gelten. Also diese Abbildung I … fasst ihre Erkenntnisse sehr gut zusammen. Ich möchte zuerst auf die Abbildung C hinweisen, wo also lose Fahrten angezeigt werden, wenn nicht-pharmazeutische Interventionen durchgeführt werden, und rote Linien Modellvorhersagen zeigen. Vor dem Ausbruch zeigte RSV also sehr klare jährliche Epidemiemuster. Als jedoch aufgrund von COVID nicht-pharmazeutische Interventionen durchgeführt wurden, gingen die RSV-Fälle schnell zurück. Das bedeutet, dass wir normalerweise im Jahr 68 einen Ausbruch haben würden. Aber da wir den Ausbruch verpassen, lassen wir die Bevölkerung keine Immunität entwickeln, die sich sonst in der Bevölkerung entwickelt hätte. Wir lassen also die Anfälligkeit zunehmen, wie wir hier in der blau gestrichelten Linie sehen, die anfälliger ist. Und wenn Anfälligkeit und Population zunehmen, können wir schließlich, wenn wir die Interventionsmaßnahmen aufheben, in Zukunft einen größeren Ausbruch bekommen.

[00:23:55] Aber es gibt große Ungewissheit darüber, wann, wie groß dieser Ausbruch sein wird, der in der obersten Reihe von Tafel A und B gezeigt wird. Wie Sie sehen können, kann es von eins bis neun reichen. Eins steht also für das gleiche Verhältnis und neun für eine neunfache Zunahme der endemischen Größe. Und es gibt auch große Ungewissheit darüber, wann die nächste Epidemie auftreten wird, die in der unteren Zeile angezeigt wird. Höchstdatum, wie Sie sehen können, könnte irgendwo zwischen 2021 und 2025 auftreten. Und diese hängen davon ab, wie lange diese Interventionen durchgeführt werden und wie stark, wie stark diese Eingriffe sind. Aber die wichtigste Erkenntnis ist, dass es vorerst gut ist, Maßnahmen zur Vorbeugung, zur Verhinderung eines Ausbruchs zu ergreifen, aber es wird dazu führen, dass die Population der Anfälligkeit weiter zunimmt, weil wir Ausbrüche verpassen, und das könnte in Zukunft zu größeren Ausbrüchen führen.

[00:25:05] Zusammenfassend konnte unsere Studie also eine starke räumlich-zeitliche Korrelation zwischen D68- und AFM-Fällen demonstrieren, was eine ökologische Unterstützung für ihre Kausalität liefert. Und wir haben auch vorhergesagt, dass ein größerer D68-Ausbruch im Jahr 2020 unter normalen Bedingungen möglich gewesen wäre. Aber die Abnahme der Kontaktrate aufgrund der aktuellen Interventionsmaßnahmen verhinderte wahrscheinlich den Ausbruch von D68 und möglicherweise den Ausbruch von AFM. Dies bedeutet jedoch, dass sich die Anfälligkeitspopulation allmählich aufbaut und wir in Zukunft einen größeren Ausbruch bekommen könnten. Daher wollten wir alle den Mitarbeitern und Mitarbeitern von danken, insbesondere den Mitarbeitern von CDC und den Gesundheitsbehörden von New York und Colorado, die ebenfalls ihre Daten geteilt haben. Vielen Dank.

Dr. Kevin Messacar: [00:26:10] Vielen Dank, Daniel. Das war wirklich, wirklich toll. Und wird ein großartiger Ausgangspunkt für Fragen im Panel sein. Ermutigen Sie das Publikum erneut, Ihre Fragen im Chat zu stellen, und wir werden versuchen, sie zu beantworten, sobald sie eintreffen. Ich werde die ersten paar Fragen angehen, aber zuerst möchte ich den Rest des Panels vorstellen. Ich möchte mit Dr. Adriana Lopez beginnen, die als Epidemiologin an den Centers for Disease Control and Prevention im Team für akute schlaffe Myelitis tätig ist und seit vielen Jahren daran arbeitet und eine der nationalen Experten für AFM-Epidemiologie ist . Dr. Charles Chiu, Dr. med., promovierter Arzt und Forscher für Infektionskrankheiten, klinischer Mikrobiologe und Sequenzierungsguru in Hülle und Fülle an der UCSF, hat viel Arbeit bei der Sequenzierung von EV-D68-Isolaten geleistet, und jetzt können Sie sehen, wie er viel tut der Sequenzierung für einige der SARS-CoV-2-Varianten und bringt eine sehr einzigartige Perspektive mit sich, sowohl von der Seite der molekularen Epidemiologie als auch von der klinischen Mikroseite der Dinge.

[00:27:19] Ich habe Dr. Daniel Park vorgestellt, der bleiben wird, und unsere letzte Diskussionsteilnehmerin wird Dr. Heba Mostafa von John Hopkins sein, die ich heute erst getroffen habe, aber ich weiß, dass sie viel Arbeit in der Epidemiologie geleistet hat Überwachung und Sequenzierung von Enterovirus-Isolaten durch die Bemühungen von John Hopkins. Ich denke, wir haben heute ein großartiges Panel. Hoffentlich kann das viele Ihrer Fragen beantworten. Ich denke, viele der Antworten werden für die Zukunft unbekannt sein, aber mit den Daten von Gen … Daniel als Ausgangspunkt werden wir versuchen, einige gute Diskussionen über die Vorbereitung zu führen und was wir tun können, wenn wir uns auf die Saison freuen kommen. Ich beginne mit den ersten paar Fragen, die im Chat auftauchten und die mit der EV-D68-Signatur auf der BioFire-Plattform zu tun hatten. Und ich fange auf dieser klinischen Testplattform von BioFire quasi ganz von vorne an. Für diejenigen, die nicht so vertraut sind, ist BioFire ein kommerzielles Unternehmen, das Plattformen für klinische Tests anbietet. Ihr Atemwegspathogen-Panel ist ein Multiplex-PCR-Panel, das auf mehrere Atemwegsviren und einige Bakterien testet. Und eines der Ziele dort ist das Enterovirus, das Rhinovirus-Ziel für diese Familie von Viren, die immer noch genetisch ähnlich sind. Sie berichten nicht, ob es sich um ein Rhinovirus handelt, ob es sich um ein Eno-Enterovirus oder um diese Art von Enterovirus handelt.

[00:28:48] Sie erkannten jedoch, als sie begannen, ihr Trendprogramm zu entwickeln, ein Programm, mit dem sie identifizierte Daten von Zentren erhalten, die sich anmelden, um ihre Testergebnisse zu erhalten und eine epidemiologische Echtzeitüberwachung der Krankheitserreger bereitzustellen die durch Ihre Systemregion gehen, das Land, in dem dies einige Auswirkungen haben könnte, um unsere Überwachung des Enterovirus D68 zu verbessern, von dem viele von uns wissen, dass es keinen klinisch verfügbaren Test gibt. Nach dem Ausbruch von 2014 war die CDC wirklich der einzige Ort, an dem Sie Tests auf EV-D68 durchführen konnten. Danach entwickelten mehrere Institutionen ihre eigenen EV-D68-spezifischen PCRs, die jedoch im Allgemeinen nicht klinisch verfügbar sind. Und so waren die epidemiologischen Daten größtenteils landesweit, wenn wir sehen, wann EV-D68 auftaucht, wenn wir sehen, dass AFM-Fälle bei Daniel auftauchen, graben sich die Daten in die Signatur, die darauf zurückkommt. Was BioFire in dem Papier, das ich dort gepostet habe und das nicht Teil dieser Bemühungen war, die vor diesen Bemühungen stattfanden, getan hat, war, dass sie diese EDRV-bekannten Proben genommen haben, sie haben eine EV 68-spezifische PCR durchgeführt, um zu wissen, welche davon EV 68 waren diejenigen waren nicht, und verwenden Sie dann etwas maschinelles Lernen, um die Feinheiten der Schmelzkurven für die Rhino-Entero-Ziele zu untersuchen, die von Fall zu Fall eine Basis bilden. Aber im größeren epidemiologischen Maßstab war er in der Lage, uns in Form einer Heatmap zu sagen, wann EV 68 in welchen Regionen des Landes auftauchte, zu welcher Zeit bis zurück zu dem Zeitpunkt, als die RPP-Tests mit BioFire begonnen hatten. Dadurch konnten wir eine genauere Analyse des Zusammenhangs zwischen AFM-Fällen in diesen Regionen und der Verbreitung von EV 68 durchführen. Der wirklich unglückliche Teil, den Daniel am Ende, den ich als Antwort auf die zweite Frage in die Kommentare eingefügt habe, dort hineingeschoben hat, war, dass diese Signatur kürzlich verloren gegangen ist, als das Panel auf das RPP 2.1 aktualisiert wurde, das das SARS-CoV- 2-Ziel, hat jetzt die Fähigkeit verloren, diese EV 68-Signatur zu haben. Wir können also aus den Mustern der Vergangenheit lernen, aber wir werden dies in Zukunft nicht mehr mit der gleichen Robustheit anwenden können. Also werde ich aufhören, die Podiumsdiskussion dort in Beschlag zu nehmen. Aber Dr. Mostafa oder einer der anderen, die diese Fragen stellen, beantwortet das Ihre Fragen in Bezug auf die BioFire-Signatur? Und wieder verweise ich Sie auf das Papier von Myers und JCB.

Dr. Heba Mostafa: [00:31:40] Danke. Ja, das war großartig.

Dr. Kevin Messacar: [00:31:45] In Ordnung. Ich muss den Chat ganz schnell scannen, weil ich geredet habe. Beginnen wir mit der ersten Frage, die ich danach kommen sehe. Gibt es eine Möglichkeit, diese Tools zu verwenden, um die potenzielle Entwicklung des Virus während eines Abschwungs vorherzusagen? Würden Sie für diejenigen, die sich dessen nicht bewusst sind, eine erhöhte Variation von den aktuellen B3 und A2 und D erwarten? Es gibt eine kleine Diskrepanz in der Literatur darüber, was A2 im Vergleich zu D genannt werden soll, Unterklassen würden sie aufgrund fehlender Fälle und der daraus resultierenden immunologischen Selektion begrenzt sein? Was für eine großartige Frage, und ich würde anfangen, wenn einer der Diskussionsteilnehmer sonst einspringen möchte, ich, ich wies auf Charles hin, um zu beginnen, er hat viel Arbeit an Varianten für SARS-CoV-2 geleistet, das sind RNA-Viren, Was würden wir in einem Jahr mit geringer Auflage erwarten, was die Änderung der Ansprüche und die Entwicklung betrifft? Was würde Ihre Erfahrung nahelegen?

Dr. Charles Chiu: [00:32:43] Ja, das ist eine großartige Frage. Und wissen Sie, ich, ich würde, ich würde sofort sagen, dass wir wahrscheinlich nicht genau wissen, was in Bezug auf die Evolution passieren wird. Und ein Teil des Grundes, warum es so schwierig ist, ist, dass es, wie Sie wissen, nur sehr wenige tatsächliche Fälle gegeben hat. Sie wissen, dass es allgemein einen starken Rückgang der Fälle bei RNA-Viren und Entero-Enteroviren, RNA-Viren gegeben hat. Bei RNA-Viren würden Sie erwarten, dass das Auftreten von, von, von, von Mutationen und Selektion und im Wesentlichen die Evolution von, von Variationen typischerweise auftritt, wenn Sie eine fortlaufende Replikation haben. Also je mehr Fälle im Allgemeinen, desto wahrscheinlicher ist es, dass wir Variationen sehen werden. Ich würde erwarten, dass es während dieses Abschwungs wahrscheinlich weniger Schwankungen geben wird. Also, ich wäre dort, würde … Aber das andere, wovor ich warnen muss, ist, dass Enteroviren sehr, da gibt es eine Menge speziell über Enteroviren, die wir nicht wirklich wissen. Obwohl die, Sie wissen schon, einige der … Arbeiten, die Daniel präsentierte, fantastisch sind.

[00:33:50] Es ist, es, es ist immer noch die Tatsache, dass wir bei vielen Ausbrüchen nicht genau wissen, warum bestimmte Kladen oder bestimmte genetische Abstammungslinien des Virus es tun werden neigen dazu, vorherrschend zu sein, sagen wir bei einem bestimmten Ausbruch gegenüber einem anderen. Und es gibt tatsächlich mehrere Gründe, von denen einer einfach eine zufällige genetische Drift sein könnte. Also, was wir den Gründereffekt nennen, wo er im Wesentlichen nur in einer anfälligen Population auftritt. Wenn Sie einen haben, wenn alles andere gleich ist, wenn Sie zum Beispiel mehrere Enterovirus-Stämme haben, die alle die Fähigkeit haben, AFM zu verursachen … und, und, in einigen Fällen, kann es zufällig sein, wo Sie sind nur zufällig einen Ausbruch an der richtigen Stelle mit, bei der anfälligen Bevölkerung.

[00:34:38] Also würde ich sagen, dass wir es derzeit nicht genau wissen, ich würde vorhersagen, dass wir wahrscheinlich keinen großen Unterschied sehen werden, obwohl das sicherlich sein könnte, das kann sicherlich falsch sein Sie wissen, gegeben, gegeben, wie ich bereits sagte, die Schwierigkeit, genau vorherzusagen, welche Kladen von Enteroviren mit einem bestimmten Ausbruch in Verbindung gebracht werden. Aber ich denke, dass es … die Frage wirklich, ich denke, wichtig ist, da sie wirklich die Notwendigkeit hervorhebt, tatsächlich eine genomische Überwachung durchzuführen. Und so, so Dr. Messacar, Kevin erwähnte darüber derzeit, dass es derzeit schwierig sein wird, eine Überwachung mit dem BioFire durchzuführen, weil wir nicht in der Lage sind, Enteroviren zu identifizieren. Aber ich würde tatsächlich noch einen Schritt weiter gehen und sagen, dass wir, wir, ohne Genomsequenzierung keine Möglichkeit haben werden, Kladen zu identifizieren. Und so denke ich, dass es letztendlich wirklich wichtig sein wird, die genomische Überwachung des Enterovirus D68 fortzusetzen, so wie wir derzeit beispielsweise die genomische Überwachung des SARS-Coronavirus-2 durchführen.

Dr. Kevin Messacar: [00:35:44] Dr. Mostafa, haben Sie etwas hinzuzufügen? Ich weiß, dass Sie viel über molekulare Epidemiologie von … gearbeitet haben.

Dr. Heba Mostafa: [00:35:50] Ja, ich wollte auch Dr. Chius Erklärung der ersten Hälfte der Frage weiterverfolgen, bei der es hauptsächlich um die Werkzeuge geht, die sich unterscheiden können – die tatsächlich zwischen den verschiedenen Kladen unterscheiden können. Und das verdeutlicht ein wenig die verschiedenen Optionen, die wir normalerweise haben. Die diagnostischen Ansätze im klinischen Labor für Enteroviren beruhen also auf dem Nachweis einer Art konservativem Bereich im Genom, der die fünf wichtigsten UTR-Regionen darstellt. Und diese Region unterscheidet normalerweise nicht zwischen Enteroviren und Rhinoviren. Und das ist der gleiche Ansatz, den auch der BioFire-Aufsatz verwendet. Um also in der Lage zu sein, die Genome zu betrachten und D68 im Vergleich zu anderen zu identifizieren oder auch die verschiedenen Unterklassen zu unterscheiden, müssen wir uns eine ähnlichere Art ansehen oder eine bestimmte Region im Genom typisieren, die die VP1-Region war. Und das, es gibt wie die klassische Methode, dies mit Sanger-Sequenzierung zu tun, was bei Enteroviren leider nicht sehr häufig gemacht wurde.

[00:37:09] Und das ist der Grund, warum wir landesweit nicht viele Daten über die Enterovirus-Überwachung haben. Diese BioFire-Methode zum Abschließen von Unterschriften ist eigentlich sehr elegant, weil dies ein Aufsatz ist, der klinisch verwendet wird. Sie können also wirklich viele Daten haben, wenn diese Empfindlichkeit akzeptabel ist, was meiner Meinung nach der Fall ist. Die andere Sache, die ich hervorheben wollte, ist, dass diese Kladen- oder Unterkladen-Daten, die wir haben, damals hauptsächlich auf dieser VP1-Sequenz basierten, aber dann sind nicht zu viele ganze Genome verfügbar, um uns auch mehr Informationen zu geben. Also, es ist tatsächlich dabei, eine weise Überwachung zu machen und uns dann zu implementieren, um ein besseres Verständnis dafür zu schaffen, wie die Zirkulation, die Evolution und die verschiedenen Arten, die an verschiedenen Orten zirkulieren.

Dr. Kevin Messacar: [00:38:10] Vielen Dank. Ich denke, wenn es eine Sache gibt, über die wir uns alle einig sind, dann auf dem Podium, dass wir eine bessere molekulare Epidemiologie und eine bessere Sequenzierung von Enteroviren im Allgemeinen brauchen. Für diejenigen unter Ihnen, die es vor der nächsten Bildschirmwebsite noch nie gesehen haben, eine XP-Website, SPR AI N-Website, betreibt molekulare Epidemiologie für eine Reihe neu auftretender Krankheitserreger und hat Enterovirus D68 darin aufgenommen, und sie nehmen alle öffentlich verfügbaren, sequenzierten isoliert über DP1 ein oder ganzes Genom und auf der ganzen Welt und führt eine schöne phylogenetische Analyse und geografische Analyse durch, welche Ströme wo zirkulieren. Dies ist jedoch extrem begrenzt durch die Herkunft der Sequenzen. Wenn die Dinge also keine Reihenfolge bekommen, werden sie dort nicht auftauchen. Und ich denke, Dr. Mostafa und Dr. Chiu haben beide sehr deutlich darauf hingewiesen, dass wir mehr Sequenzierung von mehr Isolaten brauchen.

[00:39:07] Ich werde Dr. Lopez als nächstes anrufen, weil die CDC und andere, denke ich, erkannt haben, dass unsere Enterovirus-Überwachung durch das National Enterovirus Surveillance System für lange Zeit ein ziemlich passives System war, aber hat begonnen, die Bemühungen zu verstärken, einschließlich der Einbeziehung einiger zusätzlicher Überwachungsnetzwerke, um die Überwachung des Enterovirus D68 zu verbessern. Also, Dr. Lopez, Sie wollen über NBSN und einige der anderen Bemühungen der CDC sprechen?

Dr. Adriana Lopez: [00:39:35] Sicher. Danke, Kevin. Ja, wie Kevin schon erwähnte, wir haben ein neues Impfstoffüberwachungsnetzwerk zusammengestellt, das sich mit einem aktiven potenziellen bevölkerungsbasierten Überwachungsnetzwerk befasst hat. Und es ist für akute Atemwegserkrankungen bei Kindern unter 18 Jahren. Und was passiert ist, dass wir Kinder einschreiben, die ins Krankenhaus eingeliefert werden oder Notaufnahmen in sieben medizinischen Zentren in den USA aufsuchen. Und Proben, die von diesen Patienten gesammelt und dann getestet wurden. Und das war ursprünglich für akute Atemwegserkrankungen, und dann haben wir vor ein paar Jahren AFM hinzugefügt. Und so testen sie von Juli bis Oktober Proben von den meisten Teststandorten, um nach der Zirkulation und Typisierung von Enteroviren zu suchen. Sie werden also testen und einige Standorte werden alle Proben speziell auf EV-D68 testen, andere werden nur diejenigen testen, die Enterovirus- und Rhinovirus-positiv sind, und sich dann diese zum Testen ansehen.

[00:40:40] Das haben wir also in Bezug auf die aktive Überwachung verwendet, um die Zirkulation von Enteroviren zu suchen und zu überwachen, um als mögliche Warnung für uns für AFM zu dienen. Also haben wir das in den letzten Jahren verwendet. Und im Jahr 2020, wissen Sie, ich weiß nicht, ob viele von Ihnen wissen, dass es im Jahr 2020, wie Brian erwähnte, nicht viele Fälle gab, wie wir erwartet oder erwartet hatten. Wir hatten insgesamt 31 bestätigte Fälle. Im Jahr 2018 hatten wir 238. 2020 war also eher ein Jahr ohne Spitzenwerte. Und wir haben uns unsere Daten von unseren NBSN-Sites angesehen, um zu sehen, was in Bezug auf die Enterovirus-Zirkulation und die EV-D68-Zirkulation vor sich ging. Wir haben gesehen, dass auf einigen Websites EV-D68 erkannt wurde. Aber das war sehr ortsspezifisch, nicht alle Seiten hatten es. Und es waren niedrige Zahlen, though. Aber was interessant war, war nur, dass die Zahlen, die wir gesehen haben, etwas höher waren als das, was wir in Nicht-Spitzenjahren sehen würden, aber viel niedriger als das, was wir 2018 gesehen haben.

[00:41:55] Es war also interessant, sich das anzusehen. Und sie testen bis Dezember weiter auf EV-D68, nur um zu sehen, ob die Pandemie vielleicht eine Verschiebung und Zirkulation verursacht hat, aber sie hatten im Dezember keine Nachweise. Und wir schauen uns auch unser nationales Enterovirus-Überwachungssystem an, um zu sehen, ob es Möglichkeiten gibt, das zu verbessern, das ist ein passives System. Einer der Hauptberichterstatter dieses Systems ist CDC. Also die Proben, die wir in dieses System stecken könnten, aber es hängt wirklich davon ab, welche Labore an dieses System berichten. Hoffentlich können wir unsere Beteiligung erhöhen, um auch dieses System zu stärken.

Dr. Kevin Messacar: [00:42:43] Großartig, vielen Dank, Adriana. Für diejenigen, die Fragen einreichen und sich damit wohl fühlen, versuchen Sie, den Knopf zu drücken, um sie nicht nur an alle Diskussionsteilnehmer, sondern auch an das Publikum zu senden, da ich eine Menge wirklich interessanter Kommentare bekomme, aber ich glaube nicht jeder kann, kann sie sehen. Ich glaube also nicht, dass die Leute sie privat schicken wollen. Aber wenn es Ihnen nichts ausmacht, senden Sie Ihre Kommentare an das gesamte Publikum, das uns helfen wird, mitzumachen. Ich nehme die nächste Frage, die nicht öffentlich gestellt wurde. Aber es ist von Dr. Amary Fall, der, für diejenigen unter Ihnen, die seine Arbeit noch nicht kennen, einer der wenigen Menschen in Afrika ist, in Westafrika, die molekulare Arbeit mit Enteroviren und mit EV-D68 machen, einige nette Artikel herausgebracht hat dass dies kein isoliertes nordamerikanisches oder europäisches Problem ist. Dies zeigt sich wirklich auf der ganzen Welt. Und er stellte die Frage, die uns alle beschäftigt, nachdem wir Daniels Präsentation gesehen haben, wissen Sie, mit dem Tief im Jahr 2020, was erwarten wir in Bezug auf diese Rückkehr? Und ich werde das ein bisschen in eine andere Richtung lenken, denn ich denke, wir haben über die Schwankungen von Jahr zu Jahr gesprochen.

[00:43:49] Und meine persönliche Meinung dazu ist, dass Enteroviren keine geraden Zahlen mögen, es gibt keinen Grund, warum sie 2014, '16, '18 kamen, sie brauchen nur warme Körper, die zirkulieren können. Und so würde die Tatsache, dass wir das große Auflagenjahr 2020 verpasst haben, sicherlich bedeuten, dass es 2021, 2022 anfälligere Kinder da draußen gibt, und hängt wirklich davon ab, welche Minderungsstrategien vorhanden sind. Also werde ich die schwierigere Frage an die Gruppe mit anderen Atemwegsviren stellen, zum Beispiel RSV und vielleicht beginnen, vielleicht ein wenig mit Influenza zu sehen, die sozial distanziert waren, keine normalen Zirkulationsperioden sahen. Wir sehen allmählich einige Anzeichen für ein nicht saisonales Auftreten, insbesondere bei RSV in Australien, wo es einen ziemlich großen RSV-Ausbruch gab, der nicht in ihrer typischen RSV-Saison stattfand. Also, wenn wir sehen, dass Enteroviren zurückkommen, weil ich auf Carlos' Titel dieser Präsentation antworten werde, 'Werden Enteroviren zurückkommen?' Ja sie werden. Wir wissen nicht welches, wir wissen nicht wann.

[00:44:52] Aber wenn sie zurückkommen, würden Sie erwarten, dass sie in unseren gemäßigten Gebieten, wo sie normalerweise im Sommer bis zum Herbst auftauchen, dass sie in diesem bestimmten Zeitraum wieder auftauchen? Oder sollten wir unsere Überwachung erweitern, wie es die CDC mit einigen ihrer Überwachungsnetzwerke getan hat, um nach einer nicht saisonalen Verbreitung zu suchen? Könnten sie im Winter auftauchen, könnten sie in einer Saison auftauchen, auf die wir nicht wirklich vorbereitet waren? Und jeder, der auf diese hohe Granate springen möchte, ist frei.

Dr. Heba Mostafa: [00:45:21] Vielleicht kann ich damit beginnen, dass wir ein bisschen von unseren eigenen Daten aus dem klinischen Labor für die Saison geben. Sie haben also Recht, dass dies eine sehr einzigartige Grippesaison oder Spinnengrippesaison ist, die sich als wirklich nicht die Grippesaison herausstellt. Wir haben also bis vor kurzem keine Influenza oder RSV gesehen, als wir anfingen, sehr, sehr wenige zu sehen, wie vielleicht drei RSV und drei Grippe. Aber wir hörten nicht auf, Grind/Anthro-Positive zu sehen. Wir sehen also das ganze Jahr über Positives. Die Gesamtzahlen waren hier geringer als bei einem herkömmlichen Schrank. Aber auch die Menge, die Gesamtzahl der Getesteten war geringer, weil die Kliniken geschlossen waren und viele Praxen geschlossen waren. Aber es war faszinierend, dass das Entero-Rhino-Nashorn mit erweiterter Atmung wie das Hauptziel erkannt wurde, gefolgt von sehr wenigen Fällen von hinzugefügtem Virus.

[00:46:23] Wir haben bei Entero-Rhino-Viren damit begonnen, dies im Jahr 2019, und wir sehen uns weiterhin 2020-Exemplare an. Und es ist tatsächlich bemerkenswert, weil Sie … da, wie ich diese Essays aus den erweiterten Panels erwähnt habe, sie tatsächlich nicht zwischen Rhino- und Enteroviren unterscheiden. Also haben wir unseren Algorithmus tatsächlich damit begonnen, diese Positiven mit einem etwas spezifischeren PCR-Aufsatz zu testen, der spezifischer für Enteroviren sein kann, und ein sehr, sehr kleiner Prozentsatz davon war positiv, wobei dieser spezifischere Aufsatz darauf hinweist, dass das Hauptvirus zirkuliert ist eigentlich Rhino und dann innerhalb dieser Positiven, wir haben sie mit Sanger sequenziert, gibt es die Methode, um zu tippen. Und es war im Grunde auch interessant zu sehen, dass ein großer Prozentsatz von ihnen an Nashörner gebunden war. Und dann sahen wir innerhalb der sehr winzigen Zahlen dieser Art und Entero mehr Enterovirus, D68 und 2020, als im Jahr 2019.

[00:47:37] Aber es ist immer noch wie eine kleine Zahl. Also wir, wir … ich, ich sollte sagen, wir hatten das Enterovirus D68, das 2020 im Umlauf war. Warum also, warum haben wir keine Ausbrüche und so weiter gesehen? Ich denke, es liegt immer noch an dem einzigartigen Muster des Jahres mit sozialer Distanzierung und allem, was vorhanden ist, aber es ist auch bemerkenswert, dass es im Umlauf war. Ich werde jemand anderem die Chance geben, einzuspringen.

Dr. Adriana Lopez: [00:48:06] Nun, ich wollte nur sagen, dass es bei den NBSN-Sites ein paar Sites gibt, die das ganze Jahr über testen. Also schauen sie sich das auch an. Aber wir starten auch ein Projekt mit unseren Programmen für neu auftretende Infektionen und zwei Standorten, um eine Enterovirus-Überwachung durchzuführen, die sich mit schwereren neurologischen Erkrankungen befasst, aber das wird auch im Hinblick auf die Untersuchung der Enterovirus-Zirkulation hilfreich sein.

Dr. Kevin Messacar: [00:48:34] Und ich würde nur unsere lokalen Daten hinzufügen, wir haben im Jahr 400 über 2020 Exemplare getestet und hatten kein einziges und diese sind alle EVRV-positiv in den Bihar-Daten haben ein einziges EV-D68-positives Gut Ich war fleckig, wie in und BSN zu sehen war, wo bestimmte Bereiche eine geringe Auflage sahen. Aber landesweit haben wir keinen großen Ausbruch gesehen. Dr. Mostafa, Sie haben eine andere Frage aufgeworfen, die ich Daniel und Adriana nahebringen werde, die mir bisher noch niemand erklären konnte. Ich habe meine eigenen Theorien. Aber warum tauchten Rhinoviren zuerst auf? Als wir sahen, wie Atemwegsviren nach der anfänglichen Abriegelung wieder auftauchten, … könnte dies dadurch erklärt werden, dass die verschiedenen Viren nicht vorhanden sind, SARS-CoV-2 ist, wie Sie wissen, das stärkste und zirkuliert weiterhin mit fehlender Immunität Dort könnte das Rhinovirus weniger oder weniger als SARS-CoV-2 sein, aber EV 68 möglicherweise weniger als das. Warum sehen wir Rhinoviren auftauchen, aber wir haben nicht so viele Enterovirus-Erkrankungen gesehen?

Sang (Daniel) Woo Park: [00:49:44] Ich weiß es leider auch nicht. Es ist etwas, das wir alle wissen wollten, aber ich habe oben Hypothesen gehört, die vielleicht etwas damit zu tun haben, dass einige der Viren eingehüllt sind und einige von ihnen nicht. Aber ich habe keine Antworten darauf, warum es Rhinovirus gibt. Aber es scheint ein sehr hartnäckiges Muster in verschiedenen Ländern zu sein, nicht nur in den USA. Wir sehen es in asiatischen Ländern, europäischen Ländern, dass Rhinoviren in diesen Ländern zu überleben scheinen, selbst wenn andere Krankheitserreger der Atemwege nicht zurückgekommen sind, wenn andere Krankheitserreger der Atemwege im Grunde ausgestorben sind.

Dr. Kevin Messacar: [00:50:32] Ja

Dr. Heba Mostafa: [00:50:32] dass glücklicherweise [

Dr. Kevin Messacar: [00:50:33] Übersprechen 00:51:00] - Adriana und du könnten herumlaufen -

[00:50:34] [lacht].

[00:50:35] [lacht].

Dr. Adriana Lopez: [00:50:36] Ja, leider habe ich eigentlich keine weiteren [lacht] Fragen. Feedback zu dem, was Brian gesagt hat, es ist schwer zu sagen, warum, aber wir werden weiter darüber nachdenken und versuchen, verschiedene Dinge zu erforschen. Aber ja, im Moment sind wir uns nicht nur nicht sicher.

Dr. Kevin Messacar: [00:50:59] Und ich möchte einen schnellen praktischen Punkt zu Frage zwei machen, nach zwei und Mostafa kommen ein paar Kommentare über die Art von schlechter Qualität der genomischen Daten der Sequenzen, die auf EV 68 herauskommen. Und machen Sie auch darauf aufmerksam, dass wir heute viel über EV 68 gesprochen haben, aber wir wissen, dass andere Nicht-Polio-Enteroviren ebenfalls AFM verursachen können, also müssen Sie nach ihnen suchen und sich ihrer bewusst sein. Aber zu einer praktischen Frage: Was können die einsatzbereiten Kliniker in Bezug auf die Proben, die zu Ihnen kommen, um das gesamte Genom zu gewinnen, in Bezug auf die besten Proben tun? In welche Medien sollen sie eingefügt werden? Welcher Transportweg, um sie zu Ihnen zu bringen, mit der besten Chance, die hochwertigsten Daten zu erhalten, sobald sie Ihr Labor erreichen?

Dr. Charles Chiu: [00:51:49] Vielleicht kann ich das angehen. Also ich, ich glaube Kevin, du hattest da zwei Fragen. Die erste Frage in Bezug auf die Metadaten ist die Bedeutung von Metadaten und Sequenzdatenbanken. Ich werde die andere Frage angehen, die sich auf eine Probenerfassung bezieht, ich meine, unser Interesse gilt also typischerweise der Gewinnung von Genomsequenzen, wir wollen wirklich, wir wollen im Wesentlichen intakte RNA in voller Länge erhalten. Und da RNA in der Regel ziemlich labil ist, möchten wir, dass eine Probe idealerweise so schnell wie möglich oder derzeit für klinische Untersuchungen im Wesentlichen eingefroren wird. Die Anforderungen an die Probenstabilität lauten normalerweise, dass sie innerhalb von sechs Stunden nach der Entnahme eingefroren werden, und das ist nicht immer möglich. Aber, damit wir sagen können, ein klinisches Ergebnis, entweder von Met-, von einem metagenomischen Test oder von einem direkten PCR-Test, sollte innerhalb von sechs Stunden eingefroren und eingefroren werden.

[00:52:48] In Bezug auf den tatsächlichen Probentyp haben wir uns hauptsächlich mit Nasenabstrichen in UTM oder VTM befasst, obwohl ich, ich weiß, dass wir wissen, dass wir tatsächlich auch einige Studien durchgeführt haben des Speichels ähnlich, da ein Interesse daran bestand, den Speichel möglicherweise zu bewegen. Wir haben nicht gesehen, ich glaube, wir haben nicht die gleichen, die gleichen Trends wie beim SARS-Coronavirus-2 gesehen, wo wir tatsächlich tatsächlich höhere Viruslasten im Speichel sehen. Aber was würden Sie denken, dass es eine vergleichbare Viruslast geben könnte, sodass Speichel ein interessanter Probentyp für die Validierung sein könnte, insbesondere weil Sie wissen, dass viele Gruppen Speichel sammeln, wissen Sie, für SARS-CoV-2, zumindest bei ambulanten Patienten oder bei asymptomatischer Infektion.

[00:53:33] Also, und es ist eine einfachere Probe zu sammeln als ein Nasen-Rachen-Abstrich. Also in Bezug auf, solange nicht daran gedacht wurde, an mehreren Freestyles oder in Ihren zuvor zitierten oder anderen Zwecken, ich meine, normalerweise wollen wir im Wesentlichen so frisch wie möglich frisch eingefroren für die Genomsequenzierung . In Bezug auf die tatsächlichen Titer waren wir erfolgreich. Wir verwenden also eine Vielzahl von Methoden, um Enteroviren tatsächlich nachzuweisen … um ein Genom von Enteroviren zu sequenzieren. Und das liegt vor allem daran, dass Enteroviren die Titer sehr niedrig sein können. Und, und das hängt wirklich davon ab … vor allem bei Patienten mit akuter schlaffer Myelitis, bei denen ihre Präsentation mehrere Tage, in einigen Fällen Wochen nach dem Einsetzen der Symptome erfolgen kann.

[00:54:22] Da die Titer sehr niedrig sind, haben wir verschiedene Methoden zur Genomsequenzierung angewendet. Sie beinhalten also eine Tiling-Amplikon-Methode, bei der Sie im Wesentlichen Primer über das Genom entwerfen und gleichzeitig eine PCR mehrerer PCR-Reaktionen durchführen. Das ist die Idee. Wir verwenden auch eine Anreicherungsmethode mit gespikten Primern, die in meinem Labor entwickelt wurde, bei der wir im Wesentlichen Enterovirus-D68-Sequenzen anreichern, und wir erhöhen die Empfindlichkeit der metagenomischen Sequenzierung. Und dann gibt es noch ein weiteres Verfahren, das ebenfalls ein Capture-Probe-Verfahren zur Anreicherung ist. Im Allgemeinen, wenn, wenn die Zyklusschwelle durch PCR weniger als 32 ist, wir ziemlich erfolgreich waren, das gesamte Genom zu bekommen, wenn es über 32 ist, dann können wir in einigen Fällen eine partielle Genomsequenzierung bekommen, oder wir können, wie Dr. Mostafa kommentierte können wir uns entscheiden, unsere Sequenzierung auf die VP1-Genregion für Typisierungszwecke zu beschränken.

[00:55:15] Aber im Allgemeinen ziehen wir es vor, dass die Psychotherapie weniger als 32 ist, obwohl wir bei der Wiederherstellung von Genome bis zu 38 erfolgreich waren. Also, aber, aber das ist wirklich irgendwie lückenhaft oder Ihre Fähigkeit dazu Genome auf dieser Ebene wiederherstellen. Die zweite Frage, die Sie hatten und die unserer Erfahrung nach in Bezug auf klinische Metadaten wirklich relevant ist, war SARS-CoV-2. Eines der Hauptprobleme ist nicht das Problem, keine klinischen Metadaten zu erhalten, sondern das Problem Es hängt wirklich davon ab, wer die Sequenzierung durchführt und wie wir die Sequenzierung durchführen. Wenn öffentliche Gesundheitsbehörden beispielsweise Sequenzierungen für Überwachungsmethoden durchführen, gibt es oft viele Einschränkungen hinsichtlich der Metadaten, die Sie tatsächlich bereitstellen und sammeln können.

[00:55:57] In einigen Fällen hatten wir zum Beispiel Schwierigkeiten, überhaupt das Abholdatum anzugeben. Weil das Sammeldatum als potenziell ja, Sie wissen schon, eine ideenidentifizierende Information angesehen wird. Ich denke also, dass dies nicht nur in Bezug auf Enteroviren eine Herausforderung darstellt, sondern in Bezug auf die virale Sequenzierung im Allgemeinen, was die Bereitstellung von Metadaten betrifft. Ich stimme allen vollkommen zu, dass Metadaten entscheidend sind, um die klinische Relevanz und Bedeutung der Sequenzierungsinformationen zu verstehen. Tatsächlich sind Sequenzinformationen ohne Metadaten wohl nah dran. Es ist sehr, sehr, nicht sehr nützlich. Aber was wirklich getan werden muss, ist mehr Koordination zwischen Krankenhäusern, die einen Link zu klinischen Metadaten bereitstellen können, um dies zu sagen, die Genomsequenz und Patienteninformationen, und mehr Koordination zwischen Krankenhäusern und Kreisen sowie staatlichen und nationalen öffentlichen Gesundheitsbehörden, um a, a bereitzustellen Zentralisierteres Netzwerk, um nicht nur die Sequenzierung durchzuführen, sondern auch die Metadaten zu erfassen.

Dr. Kevin Messacar: [00:57:00] Vielen Dank, Charles. Wir treffen also auf die volle Stunde. Also, um es für unsere Kliniker da draußen kurz zusammenzufassen, ich, ich … die Punkte, die ich aus Charles ziehen würde, sind besonders für diese Gruppe von Interesse. Und AFM-Fälle, wir sind bereits hinter dem Acht-Ball und dass diese Patienten typischerweise etwa eine Woche nach ihrem respiratorischen prodromalen Beginn sind, also werden die viralen Titer niedriger sein. Also wollen Sie diese Probe bekommen, sobald Sie AFM vermuten. Derzeit ist das Goldstandard-Exemplar ein Nasen-Rachen-Exemplar, das das tiefe Hirnkitzel-Exemplar ist. Bis wir bessere Daten erhalten, führen wir an unserem Standort eine von CDC finanzierte Studie durch, um die Ausscheidungskurve von EV 68 zu untersuchen. Also führen wir serielle Abstriche von Kindern über 21 Tage durch, um zu sehen, wie lange sie Viren ausscheiden. Und als Teil davon werden wir tatsächlich versuchen, die intermittierenden Abstriche zu validieren, also nicht ganz zurück, sondern etwas flacher. Und viele von uns wurden wegen SARS-Cov-2 behandelt, und wir bekommen auch Speichel.

[00:57:55] Die Leute sind also an einer Zusammenarbeit interessiert. Dr. Hai Nguyen-Tran hier koordiniert eine Studie, von der Sie Proben haben sollten, um mit anderen zusammenzuarbeiten. Es wäre wirklich schön, wenn wir weniger invasive Probennahmen hätten, wenn möglich. Und wenn ich diese ganze Diskussion zusammenfassen müsste, wir begannen mit einer wunderbaren Präsentation über Vorhersagen für die Zukunft. Aber ich denke, sogar Daniel wird Ihnen sagen, dass unsere Vorhersagen nur so gut sind wie die Annahmen, auf denen sie beruhen. Und da können wir die Zukunft nicht perfekt vorhersagen, ich denke, Adriana wird sagen, wir können uns auf das vorbereiten, was kommen könnte. Ich denke also, dass Bereitschaft eine andere Diskussion ist als Vorhersage, und dass wir versuchen, die besten Daten zu verwenden, die wir können, um die kommenden Jahreszeiten vorherzusagen. Wir können unsere Vorbereitungen wirklich kontrollieren. Dann denke ich, dass die CDC auf der Seite der öffentlichen Gesundheit, diese Arbeitsgruppe, die Elterngruppe alle daran arbeiten, unser Bestes zu geben, um uns darauf vorzubereiten, falls dies zurückkommt, dass wir bereit sind, gute Exemplare zu bekommen, um besser zu werden Sequenzierung dieser Proben, um bessere Informationen zu erhalten, um diesen Kindern in Zukunft hoffentlich eine bessere Versorgung in Bezug auf Behandlung und Prävention bieten zu können.

[00:59:02] Also, ich schätze unser gesamtes Gremium für all Ihr Fachwissen und Ihre Beiträge. Was für eine wunderbare Art, das Gespräch mit Robin Roberts über den großen Erfolg und einen ICD-Code zu beginnen. Denken Sie daran, dass Sie im Oktober jetzt einen Patienten bei der Diagnose mit einem Diagnosecode für AFM codieren können, was all unseren zukünftigen Bemühungen helfen wird. Und ich möchte alle von Ihnen, die neu in der Arbeitsgruppe sind, ermutigen, an diesen monatlichen Aufrufen teilzunehmen. Es ist eine wirklich großartige kollaborative Gruppe, wir freuen uns auf die zukünftige Zusammenarbeit mit Ihnen allen. Und ich werde es an Carlos zurückgeben, um die Sache abzuschließen.

Carlos Pardo: [00:59:39] Das einzige, was ich hinzufügen möchte, ist unser großes Dankeschön an alle Diskussionsteilnehmer, an Daniel, an Charles, an Heba, an Adriana, an Robin und an Kevin, vielen Dank, dass Sie die Rolle von gespielt haben Moderator. Und Ihnen allen danke ich für die Teilnahme an diesem virtuellen Forum. Bitte tragen Sie noch einmal in Ihren Kalender ein, dass jeder Donnerstag, der dritte Donnerstag, der nächste, den wir haben werden, am 22. April um 2:00 Uhr Eastern Time ist, und ich schätze, dass viele Teilnehmer aus anderen Teilen der Welt gekommen sind. Ich sehe Teilnehmer aus Japan, aus Afrika, aus den Niederlanden und Europa. Vielen Dank, dass Sie für dieses Treffen zur Verfügung stehen. Und wir hoffen, dass Sie auch weiterhin am nächsten virtuellen Symposium teilnehmen können. Bleiben Sie gesund und danke Ihnen allen für Ihre Teilnahme an diesem Panel und Symposium. Bis bald.